可视化神器Plotly玩转小提琴图 小提琴图 分析
yuyutoo 2024-10-21 12:06 2 浏览 0 评论
大家好,本文介绍如何利用Plotly来绘制小提琴图,是一种统计类的图形,基于两种方法实现:
- 基于plotly_express
- 基于plotly.graph_objects
一、小提琴图
看下实际绘制的小提琴图效果:
那究竟什么是小提琴图?
小提琴图(Violin Plot)是一种用来显示数据分布和概率密度的图形。
它结合了之前介绍的箱型图和密度图的双重特征,能够用来显示数据的分布形状。
三、导入库及数据
先导入需要的ku:
import numpy as np
import pandas as pd
import plotly_express as px
import plotly.graph_objects as go
本文中使用的pandas中自带的消费数据:
# 采用的是消费数据tips
tips = px.data.tips()
tips.head()
四、基于点的小提琴图
首先绘制的是基于数据点的小提琴图:
fig = px.strip(
tips, # 指定数据
x='day', # xy轴
y='total_bill',
color='day' # 颜色
)
fig.show()
根据4个day的取值来分别绘制小提琴图:
五、基于Plotly_Express实现
5.1 基础小提琴图
fig = px.violin(tips,y="total_bill") # 使用total_bill数据
fig.show()
换了一份数据再绘图:
fig = px.violin(tips,y="tip") # 使用的是小费tip
fig.show()
5.2 带数据点的小提琴图
上面的图形是没有数据点的,下面是将数据点也显示在提琴图的旁边,参数是points:
fig = px.violin(
tips,
y="total_bill",
box=True, # 开启之后在小提琴图里面绘制箱型图
points='all' # all-全部 outliers-离群点 False-不显示,默认
)
fig.show()
这个案例中没有离群点,所以points=outliers或者False,结果是相同的:
5.3 分组小提琴图
通过字段的不同取值来分别绘制不同的小提琴图:
fig = px.violin(
tips,
y="total_bill", # 绘制的数据
x="day",
color="sex",
box=True,
points="all",
hover_data=tips.columns # 悬停显示的数据信息
)
fig.show()
5.4 覆盖型、分组型小提琴图
两种不同的图形主要是通过小提琴的模式来决定的,使用的参数是violinmode:
fig = px.violin(
tips,
y='total_bill',
color='sex',
violinmode='overlay', # overlay-覆盖型 group-分组
hover_data=tips.columns
)
fig.show()
fig = px.violin(
tips,
y='total_bill',
color='sex',
violinmode='group', # overlay-覆盖型 group-分组
hover_data=tips.columns
)
fig.show()
6.1 基础小提琴图
fig = go.Figure(data=go.Violin(
y=tips['total_bill'], # 绘图数据
box_visible=True, # 内部箱体是否显示
line_color='red', # 线条颜色
meanline_visible=True, # 是否显示中线
fillcolor='seagreen', # 填充色
opacity=0.5, # 透明度
x0='Tip-小提琴图' # x轴标题
))
fig.update_layout(yaxis_zeroline=False)
fig.show()
6.2 多个小提琴图
在一个画布中同时绘制多个小提琴图。在消费数据tips中的day字段有4个不同的取值:
通过一个for循环来遍历实现4个图形的绘制:
fig1 = go.Figure() # 生成一个Figure对象
# 通过循环在对象上添加4个轨迹trace
for day in day_list:
fig1.add_trace(go.Violin(
x=tips["day"][tips["day"] == day],
y=tips["total_bill"][tips["day"] == day],
name=day,
box_visible=True,
meanline_visible=True
))
fig1.show()
6.3分组小提琴图
fig2 = go.Figure()
fig2.add_trace(go.Violin(
x=tips[ tips['sex'] == 'Male' ]['day'], # 绘图的xy轴数据
y=tips['total_bill'][ tips['sex'] == 'Male' ],
# legendgroup='男', # 图例分组
# scalegroup='男',
name='男', # 图形轨迹名称
line_color='blue' # 线条颜色
))
fig2.add_trace(go.Violin(
x=tips['day'][tips['sex'] == 'Female' ],
y=tips['total_bill'][tips['sex'] == 'Female' ],
# legendgroup='女',
# scalegroup='女',
name='女',
line_color='orange')
)
# 设置箱体和中位线是否显示
fig2.update_traces(box_visible=True, meanline_visible=True)
# 小提琴图模式:overlay覆盖型 group分组
fig2.update_layout(violinmode='group')
fig2.show()
6.4 正负形小提琴图
在小提琴图中我们可以看到它是由两个部分组成的,分为negative和positive,取值不同会呈现不同的图形:
import plotly.graph_objects as go
import pandas as pd
# 如何使用pandas读取网页在线的csv文件
df = pd.read_csv("https://raw.githubusercontent.com/plotly/datasets/master/violin_data.csv")
fig = go.Figure()
fig.add_trace(go.Violin(
x=df['day'][ df['smoker'] == 'Yes' ],
y=df['total_bill'][ df['smoker'] == 'Yes' ],
# legendgroup='Yes',
# scalegroup='Yes',
name='Yes',
side='negative', # 'both-全部', 'positive-右', 'negative-左'
line_color='blue')
)
fig.add_trace(go.Violin(
x=df['day'][ df['smoker'] == 'No' ],
y=df['total_bill'][ df['smoker'] == 'No' ],
# legendgroup='No',
# scalegroup='No',
name='No',
side='positive',
line_color='lightseagreen')
)
# 设置轨迹参数
fig.update_traces(meanline_visible=True, # 中位数是否显示
points='all', # 是否显示点
jitter=0.05, # 在每个点之间加上抖动,可视化效果更好
scalemode='count') # 'width', 'count'
fig.update_layout(violingap=0, violinmode='overlay') # 设置间隔和模式
fig.show()
七、高级小提琴图
介绍两个官网中的高级小提琴图的例子:
另一个是绘制Ridgeline(脊型) Plots图形的例子,当做欣赏:
import plotly.graph_objects as go
from plotly.colors import n_colors
import numpy as np
np.random.seed(1)
data = (np.linspace(1, 2, 12)[:, np.newaxis] * np.random.randn(12, 200) +
(np.arange(12) + 2 * np.random.random(12))[:, np.newaxis])
print(data)
# 'rgb(5, 200, 200)', 'rgb(200, 10, 10)' 表示第一个和最后一个颜色,12表示个数,colortype表示类型
colors = n_colors('rgb(5, 200, 200)', 'rgb(200, 10, 10)', 12, colortype='rgb')
print(colors)
fig = go.Figure()
for data_line, color in zip(data, colors):
fig.add_trace(go.Violin(x=data_line, line_color=color))
fig.update_traces(orientation='h', side='positive', width=3, points=False)
fig.update_layout(xaxis_showgrid=False, xaxis_zeroline=False)
fig.show()
原文链接:
https://mp.weixin.qq.com/s/3VbNaJRRfDurN77VTqXRWw
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